Tek maçlık eleminasyon sisteminde oynanacak, 32 takımın katıldığı bu turda, 2. eleme turundan gelen 14 takım, 2010-2011 sezonunda Spor Toto Süper Lig'de ilk 14 sırayı alan takımlar ile eşleşti. Geçen sezon Spor Toto Süper Lig'i 15. sırada tamamlayan Sivasspor ile aynı sezon Bank Asya 1.Lig'den Spor Toto Süper Lig'e yükselen 3 takım olan Mersin İdmanyurdu, Samsunspor ve Orduspor da birbiriyle eşleşti. Maçlar, kurada küçük numarayı çeken takımın sahasında oynanacak. Normal sürenin berabere bitmesi durumunda 15'er dakikalık 2 devre uzatılacak. Burada da eşitlik bozulmazsa penaltı atışlarına geçilecek. 10-11-12 Ocak'ta oynanacak maçlarda, turu geçen 16 takım bir üst kademeye yükselecek.
Z iraat Türkiye Kupası 3. tur eşleşmeleri şöyle oluştu:
Boluspor - Gençlerbirliği
MKE Ankaragücü- Kasımpaşa
Çaykur Rizespor - Gaziantepspor
Bursaspor - Şanlıurfaspor
Bugsaş Spor - Manisaspor
Trabzonspor - İstanbul Güngörenspor
Gaziosmanpaşa- Medical Park Antalyaspor
Beşiktaş - Gaziantep Büyükşehir Bld.spor
Adanaspor - İstanbul Büyükşehir Bld.spor
Fenerbahçe - Konya Torku Şekerspor
Eyüpspor - Eskişehirspor
K.D.Ç. Karabükspor - Ünyespor
Akhisar Belediyespor - Kayserispor
Galatasaray - Adana Demirspor
Boluspor - Gençlerbirliği
Samsunspor - Orduspor
Mersin İdman Yurdu - Sivasspor